RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 ELFN1P0C7U0 828 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NEFHP12036 1026 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ADRB3P13945 408 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ACRV1P26436 265 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TEAD1P28347 426 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ALDH3A1P30838 453 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MMP12P39900 470 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V0D1P61421 351 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SATB1Q01826 763 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 DPTQ07507 201 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PTPRCAPQ14761 206 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF284Q2VY69 593 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.55□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MACC1Q6ZN28 852 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 USP30Q70CQ3 517 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GPR26Q8NDV2 337 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.55□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 FAM3CQ92520 227 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 KCNJ9Q92806 393 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 INPP5DQ92835 1189 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 VPS35Q96QK1 796 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 COPS8Q99627 209 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 GPAMQ9HCL2 828 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 WNT16Q9UBV4 365 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL33A6NCF5 533 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NEMP1O14524 444 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PLIN3O60664 434 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEC1O60732 1142 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 RHOBTB1O94844 696 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 DNTTP04053 509 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 BPGMP07738 259 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 OR56A5P0C7T3 313 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CBSLP0DN79 551 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-EP13747 358 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CPA3P15088 417 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CHRM3P20309 590 aa9.54□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 TIE1P35590 1138 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINB5P36952 375 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINB4P48594 390 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CCR3P51677 355 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MESP2Q0VG99 397 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PON2Q15165 354 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CHRNA6Q15825 494 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CST6Q15828 149 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.54□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 NXPE1Q8N323 547 aa9.54□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 CCDC63Q8NA47 563 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.54□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 ARRDC3Q96B67 414 aa9.54□□□□□ -0.88
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 COQ10AQ96MF6 247 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 BIRC8Q96P09 236 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-211ENST00000425989 P2RY12Q9H244 342 aa9.54□□□□□ -0.88
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