RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TUBBP07437 444 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PRCPP42785 496 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PGGT1BP53609 377 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP10-5P60370 271 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GRIK2Q13002 908 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HNF4GQ14541 408 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MOAP1Q96BY2 351 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 EGLN2Q96KS0 407 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 FIZ1Q96SL8 496 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC88BA6NC98 1476 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PR77 199 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf226A1L170 272 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS44E7EML9 344 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ATP2A1O14983 1001 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ASAP2O43150 1006 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GPC4O75487 556 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 AMTP48728 403 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GPR143P51810 404 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 NUDT6P53370 316 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PNLIPRP2P54317 469 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GPS2Q13227 327 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 KRT79Q5XKE5 535 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HAUS8Q9BT25 410 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HRH4Q9H3N8 390 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MMP25Q9NPA2 562 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 COPG2Q9UBF2 871 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CLIC4Q9Y696 253 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 KANSL1LA0AUZ9 987 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC72A6NJI9 287 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OR6C75A6NL08 312 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TIMM23O14925 209 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 FASLGP48023 281 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 THBS3P49746 956 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ABATP80404 500 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SREBF2Q12772 1141 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 EFNB3Q15768 340 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 KBTBD6Q86V97 674 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OR8K5Q8NH50 307 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 LYZL4Q96KX0 146 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GAD1Q99259 594 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 DCLK3Q9C098 648 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PADI1Q9ULC6 663 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 IFT140Q96RY7 1462 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 CPED1A4D0V7 1026 aa3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 MAP2K7O14733 419 aa3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 ZIC3O60481 467 aa3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 ICAM1P05362 532 aa3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 PCYT1AP49585 367 aa3.09□□□□□ -1.92
CCDC82-202ENST00000423339 MXI1P50539 228 aa3.09□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms