RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF667Q5HYK9 610 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC10A5Q5PT55 438 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMTC3Q6ZXV5 915 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC7BQ86TV6 843 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM131BQ86XD5 332 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R3BQ86XI6 285 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM217Q8N7C4 229 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP37Q8NFH4 326 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2T11Q8NH01 316 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 JADE3Q92613 823 aa-1.04□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf37Q96NL8 207 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 OSBPL11Q9BXB4 747 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ULBP2Q9BZM5 246 aa-1.04□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SFXN1Q9H9B4 322 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf75Q9HAS0 396 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS51Q9UID3 782 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH22Q9UJ99 828 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSL5Q9ULC5 683 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR37Q9Y2I8 494 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHANK1Q9Y566 2161 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRAS1Q86XX4 4008 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCA4P78363 2273 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLD2O14939 933 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 OGTO15294 1046 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRP9O43818 475 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ECDO95905 644 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-59P01825 116 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLAP06280 429 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBMY1CP0DJD4 496 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HARSP12081 509 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFI30P13284 250 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT13P13646 458 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CPN1P15169 458 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTSR1P30989 418 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CLCNKAP51800 687 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ISL1P61371 349 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHC2P98077 582 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 VLDLRP98155 873 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAX5Q02548 391 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SART3Q15020 963 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPPED2Q15777 294 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A2PQ658T7 463 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR7E24Q6IFN5 339 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF6Q6ZMV9 814 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC8DQ7L1W4 858 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC16A9Q7RTY1 509 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAUS6Q7Z4H7 955 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBQLNLQ8IYU4 475 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL4Q8N3J2 472 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS35Q8N3Z0 413 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF709Q8N972 641 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5AP2Q8NGF4 316 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARRDC2Q8TBH0 407 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP8B4Q8TF62 1192 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HDAC7Q8WUI4 952 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMBR1Q8WVP7 490 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDXPQ96GD0 296 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLFM1Q99784 485 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMC7Q9NPA0 242 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPCN1Q9ULQ1 816 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLHQ9Y253 713 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNA1EQ15878 2313 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH15Q9Y2K3 1946 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP23Q9P227 1491 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP19O94966 1318 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa-1.06□□□□□ -2.58
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