RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 FCGR1AP12314 374 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 GSTT1P30711 240 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 RPS6KA2Q15349 733 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 OR4D1Q15615 310 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 PFKFB4Q16877 469 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 GEN1Q17RS7 908 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 CLEC6AQ6EIG7 209 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 FUNDC1Q8IVP5 155 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 TTC9BQ8N6N2 239 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 DEFB118Q96PH6 123 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 HAUS8Q9BT25 410 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 SLC2A11Q9BYW1 496 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 RIC8BQ9NVN3 520 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 MARCH5Q9NX47 278 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 PACSIN3Q9UKS6 424 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-203ENST00000402697 H3BNC9 293 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 UBXN8O00124 270 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ENPP3O14638 875 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PKMP14618 531 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PSMC3P17980 439 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 POLE2P56282 527 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 GALNT3Q14435 633 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 HECTD3Q5T447 861 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 IL23RQ5VWK5 629 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 OR56A4Q8NGH8 313 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 KCNJ9Q92806 393 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 RMDN1Q96DB5 314 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SLC45A3Q96JT2 553 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ACTR3BQ9P1U1 418 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 OGDHLQ9ULD0 1010 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ARHGAP10A1A4S6 786 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SUPT3HB4E1H0 165 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PIP5K1BO14986 540 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SUPT3HO75486 399 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 CRCPO75575 148 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 UPP2O95045 317 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ESRRBO95718 433 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ESR1P03372 595 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 RHOCP08134 193 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 UMPSP11172 480 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 IL10P22301 178 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PTGER3P43115 390 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SLC11A1P49279 550 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SLC7A2P52569 658 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 DUSP4Q13115 394 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 MAP7Q14244 749 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SEMA3AQ14563 771 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 C6orf10Q5SRN2 563 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 LCN8Q6JVE9 175 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 CERS6Q6ZMG9 384 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 RNF148Q8N7C7 305 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 OR4K2Q8NGD2 314 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 NAT14Q8WUY8 206 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SEPT8Q92599 483 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ATP6V1E2Q96A05 226 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 TUBGCP3Q96CW5 907 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 B3GALT6Q96L58 329 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 LRFN2Q9ULH4 789 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 LZTS1Q9Y250 596 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PP18 115 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 VNN2O95498 520 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 GPIP06744 558 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 SMIM18P0DKX4 95 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PCSK2P16519 638 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 NR1H2P55055 460 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 ARPP19P56211 112 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 IL2P60568 153 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 IKBKEQ14164 716 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PPP4R4Q6NUP7 873 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 PAQR3Q6TCH7 311 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-203ENST00000402697 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms