RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 BTRCQ9Y297 605 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 FXYD1O00168 92 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFS3O75489 264 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ECI2O75521 394 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 RPS17P08708 135 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 FCGRTP55899 365 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TBCELQ5QJ74 424 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 LCN8Q6JVE9 175 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC58Q96CX6 371 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD60Q9BZ19 345 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CMTM6Q9NX76 183 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ACTR3BQ9P1U1 418 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 FAM50BQ9Y247 325 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 MYRFQ9Y2G1 1151 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS12A0PJE2 317 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 IL10P22301 178 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CST5P28325 142 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 GNA12Q03113 381 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP52Q8N1V2 620 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CCT7Q99832 543 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 RETREG1Q9H6L5 497 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CCSER2Q9H7U1 834 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 RRAGCQ9HB90 399 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 GPR45Q9Y5Y3 372 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0D9SEW6 157 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 H3BNH8 94 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 STX16O14662 325 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF23P17027 643 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CKMT2P17540 419 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A2P23975 617 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 IL31Q6EBC2 164 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 OR4K2Q8NGD2 314 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 HIC2Q96JB3 615 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 MED16Q9Y2X0 877 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TLR5O60602 858 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PYGLP06737 847 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 GRIK2Q13002 908 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM259Q4ZIN3 620 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 NHSL2Q5HYW2 709 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SPPL2CQ8IUH8 684 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TRIML2Q8N7C3 387 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 RMDN1Q96DB5 314 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PSKH2Q96QS6 385 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SLC52A3Q9NQ40 469 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 AURKCQ9UQB9 309 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 MTMR11A4FU01 709 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SOCS2O14508 198 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CKBP12277 381 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 FLT3LGP49771 235 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 OR7D4Q8NG98 312 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM54Q9BYV2 358 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 MUC13Q9H3R2 512 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 IKZF3Q9UKT9 509 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf81A6NN90 581 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ASLP04424 464 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA31D3P0C874 917 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PRR35P0CG20 571 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PSMA3P25788 255 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 KCNQ1P51787 676 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CAMK1DQ8IU85 385 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 MFSD2AQ8NA29 543 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 SLC45A3Q96JT2 553 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 GPR21Q99679 349 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 CAAP1Q9H8G2 361 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 OLAHQ9NV23 265 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 EGFL7Q9UHF1 273 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms