RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 SCN5AQ14524 2016 aa2.9□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PLSCR5A0PG75 271 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC72A6NJI9 287 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 M0QZ24 198 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SOCS6O14544 535 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TMCC2O75069 709 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFS7O75251 213 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP1R3DO95685 299 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CSH1P0DML2 217 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CSH2P0DML3 217 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 VPREB1P12018 145 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 RARGP13631 454 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TMPOP42166 694 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ART1P52961 327 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TERF1P54274 439 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 RRP1P56182 461 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 NLRP5P59047 1200 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TUBA1BP68363 451 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SREBF2Q12772 1141 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 EPS8Q12929 822 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MEA1Q16626 185 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CFAP58Q5T655 872 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 BRINP3Q76B58 766 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SZRD1Q7Z422 152 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC190Q86UF4 302 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PERPQ96FX8 193 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 C3orf30Q96M34 536 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 WDFY2Q96P53 400 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 DUX5Q96PT3 197 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS33BQ9H267 617 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC9A2Q9UBY0 812 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D29Q9UFV1 150 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1W2PQF6 199 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CPED1A4D0V7 1026 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CLGNO14967 610 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP2A1O14983 1001 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TPPPO94811 219 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 STARD3NLO95772 234 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 FTCDO95954 541 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 NR2F2P24468 414 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MT3P25713 68 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PON1P27169 355 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TM4SF1P30408 202 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 GCH1P30793 250 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 UBA7P41226 1012 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC15A1P46059 708 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MFAP4P55083 255 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TAS2R38P59533 333 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE1BQ01064 536 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MYBPHQ13203 477 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ACVR2BQ13705 512 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNC3Q14003 757 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT33BQ14525 404 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 EFNB3Q15768 340 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 NTRK2Q16620 822 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 C2orf68Q2NKX9 166 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CDONQ4KMG0 1287 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 JADE1Q6IE81 842 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CUZD1Q86UP6 607 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 CLIP4Q8N3C7 705 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 OR8K5Q8NH50 307 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms