RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.67□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CSRP1-201ENST00000340006 KRT222Q8N1A0 295 aa14.67□□□□□ -0.06
CSRP1-201ENST00000340006 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.67□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.66□□□□□ -0.06
CSRP1-201ENST00000340006 SMIM23A6NLE4 172 aa14.66□□□□□ -0.06
CSRP1-201ENST00000340006 PFDN6O15212 129 aa14.66□□□□□ -0.06
CSRP1-201ENST00000340006 PRSS56P0CW18 603 aa14.66□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 DCDC1P59894 354 aa14.66□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.65□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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CSRP1-201ENST00000340006 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 FOXN2P32314 431 aa14.64□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TTPAP49638 278 aa14.64□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 IRF4Q15306 451 aa14.64□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 TTMPQ5BVD1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
CSRP1-201ENST00000340006 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.64□□□□□ -0.07
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