RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312635.10

USP15-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 2,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-202ENST00000312635 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 TIFABQ6ZNK6 161 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 NXPE1Q8N323 547 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 MCMBPQ9BTE3 642 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SENP1Q9P0U3 644 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 A0A1W2PQU0 124 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CFAP99D6REC4 459 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 H3BMM5 538 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 K7ESF4 209 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 TOR1BO14657 336 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 AHSGP02765 367 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SLCO1A2P46721 670 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CTBP1Q13363 440 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SERPINA9Q86WD7 417 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 DENND6AQ8IWF6 608 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 RBFAQ8N0V3 343 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SPACA7Q96KW9 195 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 DMTF1Q9Y222 760 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ACTL7BQ9Y614 415 aa9□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SMIM23A6NLE4 172 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 QSOX1O00391 747 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 AXIN1O15169 862 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ITGA2BP08514 1039 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 RALBP11234 206 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CD9P21926 228 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ACSL1P33121 698 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 GPR1P46091 355 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 MPP1Q00013 466 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 POU4F1Q01851 419 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SEMA3AQ14563 771 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 LRRC14Q15048 493 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 TMED2Q15363 201 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 DBN1Q16643 649 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FAM124AQ86V42 546 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 LPGAT1Q92604 370 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ISL2Q96A47 359 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 VPS39Q96JC1 886 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CABS1Q96KC9 395 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 COPS8Q99627 209 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 GPR22Q99680 433 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CD84Q9UIB8 345 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 PSAT1Q9Y617 370 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 MYLKQ15746 1914 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 LAMTOR5O43504 91 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 LATO43561 262 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 UGT1A9O60656 530 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 HAUS5O94927 633 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 AP2A2O94973 939 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 ESR1P03372 595 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 KRT15P19012 456 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 GABRB3P28472 473 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 NSG1P42857 185 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 PNCKQ6P2M8 343 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 C11orf74Q86VG3 221 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-202ENST00000312635 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms