RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 ASB2Q96Q27 587 aa20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 IL37Q9NZH6 218 aa20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 PHF24Q9UPV7 400 aa20.89■□□□□ 0.94
PTDSS2-201ENST00000308020 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 LBPP18428 481 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 PBX3P40426 434 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEA11P43364 429 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 DIO3P55073 304 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRC58Q96CX6 371 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SMOXQ9NWM0 555 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM50BQ9Y247 325 aa20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 DLGAP1O14490 977 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SUPT3HO75486 399 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SOX11P35716 441 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SUOXP51687 545 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 IL10RBQ08334 325 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SERINC3Q13530 473 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 OR4L1Q8NH43 312 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 GIPC2Q8TF65 315 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 PHF12Q96QT6 1004 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TIMM22Q9Y584 194 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 PLXNA3P51805 1871 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM92AA1XBS5 289 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 AQP12BA6NM10 295 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 HSD17B1P14061 328 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 CLCQ05315 142 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 INPP5AQ14642 412 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 IFNEQ86WN2 208 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 GPR150Q8NGU9 434 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM15Q9C019 465 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 IL10P22301 178 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNQ1P51787 676 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 HPCAP84074 193 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 DUSP4Q13115 394 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 VPS33AQ96AX1 596 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 GID8Q9NWU2 228 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF112Q9ULX5 631 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 A0A0D9SEW6 157 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 MTMR11A4FU01 709 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 DRGXA6NNA5 263 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 ARPC2O15144 300 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 MATN4O95460 622 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FGF1P05230 155 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 HLA-DPA1P20036 260 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 STC1P52823 247 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF235Q14590 738 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF786Q8N393 782 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FEM1CQ96JP0 617 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TEX37Q96LM6 180 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TLR5O60602 858 aa20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 CRCPO75575 148 aa20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 RHOBTB1O94844 696 aa20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 FMO4P31512 558 aa20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 TNK2Q07912 1038 aa20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2-201ENST00000308020 BNIP2Q12982 314 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms