RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 OR52B2Q96RD2 323 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 MIPEPQ99797 713 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CDH22Q9UJ99 828 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TTC34A8MYJ7 566 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN8O00124 270 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PYGLP06737 847 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A6P19224 532 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A1P22309 533 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A4P22310 534 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A3P35503 534 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A5P35504 534 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RAD51Q06609 339 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NFATC2Q13469 925 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 EML3Q32P44 896 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC66Q68CR7 880 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RINLQ6ZS11 566 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf40Q86WS4 652 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KDM1BQ8NB78 822 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 APOL5Q9BWW9 433 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PBX4Q9BYU1 374 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NUF2Q9BZD4 464 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 DERL2Q9GZP9 239 aa22.61■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NEMP1O14524 444 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 MGRN1O60291 552 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ESR1P03372 595 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ADH5P11766 374 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 MTHFD2P13995 350 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 IMPDH1P20839 514 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 LHCGRP22888 699 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB5P36952 375 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 USP45Q70EL2 814 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SNX20Q7Z614 316 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 STK40Q8N2I9 435 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CD200R1Q8TD46 325 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 FRS2Q8WU20 508 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ9Q92806 393 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 BOCQ9BWV1 1114 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CIPCQ9C0C6 399 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO10Q9UK96 956 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 APPL1Q9UKG1 709 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 A8MUI8 341 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 E9PBE3 544 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL41O60662 606 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM24O75264 130 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 LONP2Q86WA8 852 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GPR26Q8NDV2 337 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1191Q96A73 305 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 MTG2Q9H4K7 406 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.6■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf42Q9H799 3197 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 E5RI56 91 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CISD3P0C7P0 127 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TPBGLP0DKB5 382 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA3P29320 983 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SPAM1P38567 509 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 HK2P52789 917 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NFKB2Q00653 900 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PTSQ03393 145 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KDSRQ06136 332 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TSNQ15631 228 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNA6Q15825 494 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.59■■□□□ 1.21
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