RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MARCH2Q9P0N8 246 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 RNF112Q9ULX5 631 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 LCHNA4D1U4 455 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GPIP06744 558 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SERPINF2P08697 491 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 C7P10643 843 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FASP25445 335 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GALNT3Q14435 633 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PTPRCAPQ14761 206 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FIBCD1Q8N539 461 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 KCNA7Q96RP8 456 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 C9orf16Q9BUW7 83 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SLC52A3Q9NQ40 469 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R13Q9NYV9 303 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GIMAP2Q9UG22 337 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PHF24Q9UPV7 400 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 AURKCQ9UQB9 309 aa27.87■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SYCE1LA8MT33 242 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SUPT3HB4E1H0 165 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 MUSKO15146 869 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 AOC2O75106 756 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SUPT3HO75486 399 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 NDST3O95803 873 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GRK4P32298 578 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 MTA1Q13330 715 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ANKS6Q68DC2 871 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SPPL2CQ8IUH8 684 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 MYRFLQ96LU7 910 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GPR45Q9Y5Y3 372 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GBF1Q92538 1859 aa27.86■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GJB3O75712 270 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 LINC00032P0C843 101 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FCGR1AP12314 374 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ACVRL1P37023 503 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 RAD51Q06609 339 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 GLB1LQ6UWU2 654 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 MIB1Q86YT6 1006 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FAM47BQ8NA70 645 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TNIP2Q8NFZ5 429 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FBXO32Q969P5 355 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PDFQ9HBH1 243 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PP18 115 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 DYTNA2CJ06 578 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CRCPO75575 148 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 RHOBTB1O94844 696 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 RPS17P08708 135 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PRR35P0CG20 571 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 MYF6P23409 242 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 RING1Q06587 406 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 DSC1Q08554 894 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CBR4Q8N4T8 237 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TRIB3Q96RU7 358 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SAC3D1A6NKF1 404 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 STX16O14662 325 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TBX18O95935 607 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PCSK6P29122 969 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FAM26DQ5JW98 314 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 C10orf120Q5SQS8 335 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 BBS5Q8N3I7 341 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 CCDC68Q9H2F9 335 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 EGFL7Q9UHF1 273 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 BTRCQ9Y297 605 aa27.84■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TRIM64CA6NLI5 447 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PLOD2O00469 737 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ARPC2O15144 300 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 B4GALT3O60512 393 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 RCAN2Q14206 197 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PAQR3Q6TCH7 311 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 AFTPHQ6ULP2 937 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ZNF280BQ86YH2 543 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ADGRG5Q8IZF4 528 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PFDN4Q9NQP4 134 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 SLC12A8A0AV02 714 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 KCNK10P57789 538 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 EPHX4Q8IUS5 362 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 TRPV3Q8NET8 790 aa27.83■■■□□ 2.05
UBP1-201ENST00000283628 FAM110BQ8TC76 370 aa27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms