RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CASP10Q92851 521 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GALPQ9UBC7 116 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PADI4Q9UM07 663 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ANXA9O76027 345 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 DIRAS1O95057 198 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 OR4Q2P0C623 313 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 BMP2P12643 396 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 LBPP18428 481 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GPX3P22352 226 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GJA5P36382 358 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PGFP49763 221 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SLC36A3Q495N2 470 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SFRP1Q8N474 314 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ANKFN1Q8N957 763 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 FFAR3O14843 346 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GPR42O15529 346 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 RHOBTB1O94844 696 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GSNP06396 782 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 MYF6P23409 242 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 OXCT1P55809 520 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PPIL2Q13356 520 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PTPRRQ15256 657 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ADCK1Q86TW2 530 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF560Q96MR9 790 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 POLG2Q9UHN1 485 aa16.67■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PAGE1O75459 146 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GUCA1CO95843 209 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 FTH1P02794 183 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 FMO3P31513 532 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 MTHFRP42898 656 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 MAP2K4P45985 399 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ARPP19P56211 112 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SELPLGQ14242 412 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 C14orf80Q86SX3 495 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ITFG1Q8TB96 612 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CSF3RQ99062 836 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 RASSF1Q9NS23 344 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G16P53816 162 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 POU4F1Q01851 419 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ZFP90Q8TF47 636 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CDC7O00311 574 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 AXIN1O15169 862 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TOMM70O94826 608 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 POMCP01189 267 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 BRCC3P46736 316 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CCT8P50990 548 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GSTM4Q03013 218 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 OR4D1Q15615 310 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ISCA2Q86U28 154 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 EFHBQ8N7U6 833 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 PPTC7Q8NI37 304 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 TOR3AQ9H497 397 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 BTN3A1O00481 513 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GPR39O43194 453 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 C1RP00736 705 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GPR162Q16538 588 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 BROXQ5VW32 411 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 GALNT10Q86SR1 603 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDP1-201ENST00000075430 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms