RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACOX2	Q99424	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAB1	O75553	588 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNA5	P22460	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	AMPH	P49418	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	F2RL1	P55085	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRYM	Q14894	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PS18	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SCAMP1	O15126	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF432	O94892	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FTCD	O95954	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACTN1	P12814	892 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	APBB2	Q92870	758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIGT	Q969N2	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTPRC	P08575	1304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A087X0M5	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1B0GX30	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787		M0QZ24	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TULP2	O00295	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBX18	O95935	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	S1PR1	P21453	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	FMO5	P49326	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF132	P52740	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAS2R38	P59533	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT32	Q14532	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	DECR1	Q16698	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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