RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	NPY6R	Q99463	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CHP1	Q99653	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	VCAN	P13611	3396 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087X0T9	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288		E9PAM4	449 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	AP5Z1	O43299	807 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CCP110	O43303	1012 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC14B	O60729	498 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CNTN5	O94779	1100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FSBP	O95073	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LATS1	O95835	1130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RHOC	P08134	193 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CELA3B	P08861	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM228B	P0C875	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GZMA	P12544	262 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CR2	P20023	1033 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	HLA-F	P30511	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ADRA1B	P35368	520 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PBX1	P40424	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CSK	P41240	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PRKCI	P41743	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF75D	P51815	510 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GALC	P54803	685 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LGALS4	P56470	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT83	P78385	493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LMAN2	Q12907	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF234	Q14588	700 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	E2F5	Q15329	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC6	Q16204	474 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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