RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 NEMP2A6NFY4 417 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 A8MT66 165 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TPBGLP0DKB5 382 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CPOXP36551 454 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PLK1P53350 603 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PIM3Q86V86 326 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 BBS2Q9BXC9 721 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CDYLQ9Y232 598 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 F8W8V4 182 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NEMP1O14524 444 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB14O43829 449 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CIB2O75838 187 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PDHA1P08559 390 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMA3P25788 255 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NAA25Q14CX7 972 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR149Q86SP6 731 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ACDQ96AP0 544 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPC5OSA6NMA1 111 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM24O15164 1050 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TYRP14679 529 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA5P22460 613 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHA3P29320 983 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 WEE1P30291 646 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SUOXP51687 545 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KLF10Q13118 480 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FUT11Q495W5 492 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ISCA2Q86U28 154 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM1BQ8NB78 822 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF13Q92913 245 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TCF12Q99081 682 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG9Q9H6U8 611 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 EYSQ5T1H1 3165 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 MEI4A8MW99 385 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FSHRP23945 695 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ASIC4Q96FT7 647 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 FAR2Q96K12 515 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ASB16Q96NS5 453 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM14Q96QK8 99 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 H0Y3Z8 333 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 COX4I1P13073 169 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOAP61586 193 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 ACCSLQ4AC99 568 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RETSATQ6NUM9 610 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 STMN2Q93045 179 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 MARK1Q9P0L2 795 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A2O15244 555 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFS3O75489 264 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 CD1DP15813 335 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-211ENST00000539589 GNAZP19086 355 aa20.17■□□□□ 0.82
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