RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GULP1Q9UBP9 304 aa16.58■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 KRT37O76014 449 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SPINT3P49223 89 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 RWDD2BP57060 319 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 WASHC5Q12768 1159 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GALNT3Q14435 633 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PCSK7Q16549 785 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PERM1Q5SV97 790 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GPR156Q8NFN8 814 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SCAMP4Q969E2 229 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 HAUS1Q96CS2 278 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 HIC2Q96JB3 615 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 WDR24Q96S15 920 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CDH19Q9H159 772 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CARD9Q9H257 536 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 RAD18Q9NS91 495 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 RNF14Q9UBS8 474 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SUFUQ9UMX1 484 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.57■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CSO75390 466 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 NDST3O95803 873 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FTCDO95954 541 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GNPDA1P46926 289 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 COX14Q96I36 57 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PBKQ96KB5 322 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 TLR10Q9BXR5 811 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 AK5Q9Y6K8 562 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.56■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CACNA1BQ00975 2339 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PMPCBO75439 489 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 GLB1P16278 677 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 NFKB1P19838 968 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 DCDC1P59894 354 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 NOMO1Q15155 1222 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ISXQ2M1V0 245 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 DOK6Q6PKX4 331 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ZNF567Q8N184 647 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 OR2M4Q96R27 311 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FCRL5Q96RD9 977 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 AGAP2Q99490 1192 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 VPS18Q9P253 973 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SNX12Q9UMY4 172 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ZNF711Q9Y462 761 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.55■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 B4DGG1 531 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 H7C0C1 242 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 NOBOXO60393 691 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 TJP3O95049 919 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 EPOP01588 193 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 FUCA1P04066 466 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 PNLIPP16233 465 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ADCY8P40145 1251 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 ATP5OP48047 213 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 POLD2P49005 469 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 LRP8Q14114 963 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 SPIDRQ14159 915 aa16.54■□□□□ 0.24
PKP3-209ENST00000533069 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms