RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PTPRC	P08575	1304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GU03	582 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	VCY	O14598	125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TUBB	P07437	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GNAQ	P50148	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	MMP14	P50281	582 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TAS2R38	P59533	333 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	TUBB4B	P68371	445 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GALNT2	Q10471	571 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE5	Q13069	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE6	Q13070	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	UTY	O14607	1347 aa		4.16	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
COPS5-208	ENST00000519057	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	EGF	P01133	1207 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CNTF	P26441	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CDA	P32320	146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TAF6	P49848	677 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	CUX2	O14529	1486 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SNAP23	O00161	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SPINT2	O43291	252 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TNFSF14	O43557	240 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PEX14	O75381	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	HSD3B1	P14060	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	VAMP2	P63027	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PMP22	Q01453	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FOXM1	Q08050	763 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	GPR68	Q15743	365 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	DECR1	Q16698	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms