RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AP1G1O43747 822 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ASLP04424 464 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNE1P15382 129 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YWHAQP27348 245 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SULT2A1Q06520 285 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTK2BQ14289 1009 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGKQ53H12 422 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPP9Q86TI2 863 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.59□□□□□ -1.35
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LPGAT1Q92604 370 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM209Q96SK2 561 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VTA1Q9NP79 307 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP6CO00743 305 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RGS13O14921 159 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PYGLP06737 847 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STMN1P16949 149 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CKMT2P17540 419 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UGT1A6P19224 532 aa6.58□□□□□ -1.36
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CXCR3P49682 368 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDH15P55291 814 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BEX3Q00994 111 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 XKR4Q5GH76 650 aa6.58□□□□□ -1.36
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C3orf30Q96M34 536 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GAD1Q99259 594 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MPP6Q9NZW5 540 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAB26Q9ULW5 256 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.58□□□□□ -1.36
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSC2P49815 1807 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.58□□□□□ -1.36
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR51F1A6NGY5 319 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.58□□□□□ -1.36
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HLA-DQB2P05538 268 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADH5P11766 374 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC5A2P31639 672 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PNPLA4P41247 253 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAXP61244 160 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCAPQ12770 1279 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRP8Q14114 963 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IHHQ14623 411 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.58□□□□□ -1.36
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTX3Q5HYI7 312 aa6.58□□□□□ -1.36
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