RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 GPR19Q15760 415 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FAM187BQ17R55 369 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FBLN7Q53RD9 439 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FIGNQ5HY92 759 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC38Q5VT99 294 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NEK8Q86SG6 692 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TC2NQ8N9U0 490 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 APBB2Q92870 758 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CDRT15Q96T59 188 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CHP1Q99653 195 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ACBD6Q9BR61 282 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KCNK12Q9HB15 430 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PRR13Q9NZ81 148 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KCND3Q9UK17 655 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 HELTA6NFD8 242 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FAM177BA6PVY3 158 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CENPBD1B2RD01 187 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GRM8O00222 908 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FPGTO14772 594 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SHOXO15266 292 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MSCO60682 206 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TOM1L1O75674 476 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 IFNA14P01570 189 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 IL6P05231 212 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 THBDP07204 575 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KRT7P08729 469 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 STAG3L2P0CL84 134 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CYP2C9P11712 490 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CD19P15391 556 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CTRB1P17538 263 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 VCLP18206 1134 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TNFRSF1AP19438 455 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SLC5A2P31639 672 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RORAP35398 523 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ADCY8P40145 1251 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 WNT3P56703 355 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN8P56748 225 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MERTKQ12866 999 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TSC22D1Q15714 1073 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ADRM1Q16186 407 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 NRN1LQ496H8 165 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM31Q5JXX7 168 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 CDC73Q6P1J9 531 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 C4orf19Q8IY42 314 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 WDR48Q8TAF3 677 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DPF2Q92785 391 aa7.25□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 COPS5Q92905 334 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms