RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 AGBL5Q8NDL9 886 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAMP4Q969E2 229 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 COX14Q96I36 57 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.43■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 MATN3O15232 486 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SERPING1P05155 500 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CD48P09326 243 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 THRAP10827 490 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SFTPCP11686 197 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CA4P22748 312 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ARSEP51690 589 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NFATC3Q12968 1075 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM117AQ9C073 453 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 STARD5Q9NSY2 213 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CSF2RBP32927 897 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 DPYSL3Q14195 570 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM74Q86UV6 250 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 EXD1Q8NHP7 514 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TSGA13Q96PP4 275 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM14Q96QK8 99 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 LYSMD1Q96S90 227 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF670Q9BS34 389 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 DDA1Q9BW61 102 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CLMPQ9H6B4 373 aa22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 WT1P19544 449 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CCNCP24863 283 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 PBX1P40424 430 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP1A2P50993 1020 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ARSDP51689 593 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 DSC2Q02487 901 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 IHHQ14623 411 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SFRP1Q8N474 314 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 IQCDQ96DY2 449 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 AGAP2Q99490 1192 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS18Q9P253 973 aa22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A087X0T9 212 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM228BP0C875 321 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBED6P86452 979 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TBR1Q16650 682 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NKD1Q969G9 470 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 PDP2Q9P2J9 529 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CHKBQ9Y259 395 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 FLNCQ14315 2725 aa22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NBASA2RRP1 2371 aa22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 B4E171 279 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 WISP1O95388 367 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 PRLP01236 227 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM87AP0C7U9 286 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGB6P18564 788 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPAN7P41732 249 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 RAB15P59190 212 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNC4Q03721 635 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 PDK2Q15119 407 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 OR10G6Q8NH81 332 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ART4Q93070 314 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 PMEPA1Q969W9 287 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 INPP4BO15327 924 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 DUX1O43812 170 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC6O75061 913 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 CLDN7O95471 211 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ASMTLO95671 621 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 MX2P20592 715 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 TPM4P67936 248 aa22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 FANCCQ00597 558 aa22.38■■□□□ 1.17
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