RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 RAD51BO15315 384 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PRAMEF11O60813 436 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC6A4P31645 630 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 GPR1P46091 355 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 DGKGP49619 791 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MAPK10P53779 464 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNK10P57789 538 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM25Q86YD3 366 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 INPP5DQ92835 1189 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 A8MUI8 341 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 HDAC3O15379 428 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TCEA3O75764 348 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT16P08779 473 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 THRAP10827 490 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SGCGQ13326 291 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FLOT2Q14254 428 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARSIQ5FYB1 569 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM233B4DJY2 109 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 E7ESA3 106 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MAN1A2O60476 641 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 UNC5CO95185 931 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PCNAP12004 261 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 OCA2Q04671 838 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 GRM2Q14416 872 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MAPRE2Q15555 327 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TBCCQ15814 346 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM26DQ5JW98 314 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MBLAC2Q68D91 279 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf74Q96LT6 269 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CDRT15Q96T59 188 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RMI1Q9H9A7 625 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PQ67 120 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RFPL1O75677 317 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ADH1CP00326 375 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PRKCHP24723 683 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ERVFC1P60507 584 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM189BP81408 668 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM198Q66K66 360 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 EME1Q96AY2 570 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ASB3Q9Y575 518 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 GPR39O43194 453 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 E2F6O75461 281 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MYO1DO94832 1006 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK14O94921 469 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FSBPO95073 299 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ACADMP11310 421 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 HNF4AP41235 474 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ECT2LQ008S8 904 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 UBE3AQ05086 875 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP1A4Q13733 1029 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 RAB33AQ14088 237 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CCT7Q99832 543 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CLDND1Q9NY35 253 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 OPTCQ9UBM4 332 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 AKAP10O43572 662 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1I1O60431 355 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms