RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482072.1

ABCA9-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 3

Gene ABCA9, Length 235 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072		A0A1B0GVM2	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072		A0A1W2PPC1	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072		H0YIN7	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ADAM10	O14672	748 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CLGN	O14967	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	NDUFB8	O95169	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	FTCD	O95954	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CYP1A2	P05177	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	FYN	P06241	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	NAGA	P17050	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	STX2	P32856	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	PLCD1	P51178	756 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SIRPA	P78324	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	TMF1	P82094	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	FOXM1	Q08050	763 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	DCST1	Q5T197	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	MMP21	Q8N119	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072		A0A1W2PR77	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072		M0QZ24	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	PSMA7	O14818	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	VNN2	O95498	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ICAM1	P05362	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CELA2A	P08217	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CPT2	P23786	658 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CD38	P28907	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	THPO	P40225	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	FASLG	P48023	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	MMP14	P50281	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	TERF1	P54274	439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	P2RX3	P56373	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	KRT83	P78385	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	PTGR1	Q14914	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	GGN	Q86UU5	652 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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