RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 LINGO2Q7L985 606 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA21Q7Z572 469 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP14Q86W24 1093 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HES6Q96HZ4 224 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGMQ9H3S5 423 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MAST3O60307 1309 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0B4J293 547 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CPED1A4D0V7 1026 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 OOEPA6NGQ2 149 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 VCYO14598 125 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHDP01880 384 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 KLKB1P03952 638 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HMOX1P09601 288 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52Z1P0C646 297 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TFPIP10646 304 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ADRA2CP18825 462 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TFEBP19484 476 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF8P28908 595 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SELENOPP49908 381 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B7P56937 341 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 STX1BP61266 288 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ASIC1P78348 528 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PMPCAQ10713 525 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SREBF2Q12772 1141 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPRCAPQ14761 206 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG10Q5BKT4 473 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX38Q6PEX7 206 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17DQ8TAD2 202 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 LENG9Q96B70 501 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NXNL1Q96CM4 212 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 NEK1Q96PY6 1258 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SPXQ9BT56 116 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CNIH4Q9P003 139 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM202A6NGA9 273 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 INPPL1O15357 1258 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 MOSPD3O75425 235 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PLAUP00749 431 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 GH2P01242 217 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ICAM1P05362 532 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXC9P31274 260 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 YPEL5P62699 121 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ARF5P84085 180 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PPATQ06203 517 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SPOCK1Q08629 439 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSM1Q08AH1 577 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TEFQ10587 303 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 VWC2Q2TAL6 325 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM153CQ494X1 144 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP85Q6P2H3 762 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM270Q6UE05 265 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms