RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE7	O76087	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	BEST1	O76090	585 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ACTN1	P12814	892 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MAOA	P21397	527 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PRCP	P42785	496 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PEX5	P50542	639 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ART1	P52961	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	LRMP	Q12912	555 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GRIK2	Q13002	908 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE1	Q13065	139 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE4	Q13068	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ACOX2	Q99424	681 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf226	A1L170	272 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	VCY	O14598	125 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HSPA12A	O43301	675 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ZIC3	O60481	467 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	FTCD	O95954	541 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CYC1	P08574	325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	DAO	P14920	347 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	AKR1B1	P15121	316 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	SAT1	P21673	171 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HOXC9	P31274	260 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TAS2R40	P59535	323 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	POC5	Q8NA72	575 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454		J3KR12	359 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TPPP	O94811	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	G6PD	P11413	515 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	PON1	P27169	355 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	STX2	P32856	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	NNMT	P40261	264 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MFAP4	P55083	255 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TUBA1B	P68363	451 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CLK1-208	ENST00000464454	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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