RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MPPE1Q53F39 396 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UNC50Q53HI1 259 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR158Q5T848 1215 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 DERL2Q9GZP9 239 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MUC3BQ9H195 1237 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 ACSS2Q9NR19 701 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 GALPQ9UBC7 116 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 H0Y626 953 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CHUKO15111 745 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 GLUD1P00367 558 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LRG1P02750 347 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CKMP06732 381 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FGF4P08620 206 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 CCND1P24385 295 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 CLCN7P51798 805 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 RHOAP61586 193 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB16Q05516 673 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FPGSQ05932 587 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ASPHQ12797 758 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PTK2BQ14289 1009 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GBX1Q14549 363 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TAF12Q16514 161 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GAB4Q2WGN9 574 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RETSATQ6NUM9 610 aa5.62□□□□□ -1.51
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