RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GALPQ9UBC7 116 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RNF112Q9ULX5 631 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 KRT87PA6NCN2 255 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 AXIN1O15169 862 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ANXA9O76027 345 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 H6PDO95479 791 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CYP4B1P13584 511 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 IL7RP16871 459 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 OR1E1P30953 314 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 NR1H2P55055 460 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 DGCR6Q14129 220 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 OR4D1Q15615 310 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 KLHL35Q6PF15 583 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GALNT10Q86SR1 603 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 LINC00523Q86TU6 105 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 STK32CQ86UX6 486 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 NCLNQ969V3 563 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ASB9Q96DX5 294 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 FAM117AQ9C073 453 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 HACD3Q9P035 362 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 A0A0D9SEW6 157 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 MAGEB16A2A368 324 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 NCAM2O15394 837 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GSNP06396 782 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PSEN2P49810 448 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SEMA3BQ13214 749 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ZNF235Q14590 738 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 IHHQ14623 411 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 LPIN1Q14693 890 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 FIBCD1Q8N539 461 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GIPC3Q8TF64 312 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 HAPLN3Q96S86 360 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 OSER1Q9NX31 292 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RAB26Q9ULW5 256 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 DMTF1Q9Y222 760 aa8.85□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SCN4AP35499 1836 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TLR5O60602 858 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 KCNE1P15382 129 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 FOSL1P15407 271 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 IL10P22301 178 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GDF5P43026 501 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 GEMP55040 296 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CASP9P55211 416 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 RHDQ02161 417 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 TWF1Q12792 350 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 METTL23Q86XA0 190 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 OR7D4Q8NG98 312 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ELMO1Q92556 727 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 ADI1Q9BV57 179 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 KIFC1Q9BW19 673 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 OLAHQ9NV23 265 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.84□□□□□ -0.99
THBS3-201ENST00000368378 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms