RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 FAM50BQ9Y247 325 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 KLF11O14901 512 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEF1O95521 474 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 COL6A2P12110 1019 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ARRB2P32121 409 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CACNG1Q06432 222 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 STX3Q13277 289 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ITGA9Q13797 1035 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 USP45Q70EL2 814 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TTC7BQ86TV6 843 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TSPAN17Q96FV3 270 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TSNARE1Q96NA8 513 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TCF12Q99081 682 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 NPHS2Q9NP85 383 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CD84Q9UIB8 345 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.29■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 MYO10Q9HD67 2058 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 IQCF5A8MTL0 148 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TARM1B6A8C7 271 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD65E5RJM6 399 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 RHOBTB1O94844 696 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 C1SP09871 688 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 RALBP11234 206 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 KCNC1P48547 511 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TTPAP49638 278 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ATG16L1Q676U5 607 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SLC30A3Q99726 388 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 BOCQ9BWV1 1114 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ABCG8Q9H221 673 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 XPR1Q9UBH6 696 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.28■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ARNTLO00327 626 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PLK4O00444 970 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 KAT7O95251 611 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 KITP10721 976 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 IL12RB1P42701 662 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 MTHFRP42898 656 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PAQR3Q6TCH7 311 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF398Q8TD17 642 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 FAM129BQ96TA1 746 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 DCTN4Q9UJW0 460 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.27■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 DLX3O60479 287 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 NIPSNAP2O75323 286 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 ECI2O75521 394 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 SPAM1P38567 509 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 SLC1A6P48664 564 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 OCRLQ01968 901 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 NFATC2Q13469 925 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 DBN1Q16643 649 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 SNX20Q7Z614 316 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 GPR21Q99679 349 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM245Q9H330 911 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 KCNK13Q9HB14 408 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 OXSMQ9NWU1 459 aa15.27■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 NEMP2A6NFY4 417 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 MYL2P10916 166 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 WASP42768 502 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 CCR10P46092 362 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 SPINT3P49223 89 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 GALK1P51570 392 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-201ENST00000368078 ITIH4Q14624 930 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms