RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 PRKCIP41743 596 aa16.02■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 CBFA2T3O75081 653 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 MTHFRP42898 656 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.02■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.02■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 BSNDQ8WZ55 320 aa16.02■□□□□ 0.16
RXRA-201ENST00000356384 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 BRINP2Q9C0B6 783 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 SNAPC1Q16533 368 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 GMEB1Q9Y692 573 aa16.02■□□□□ 0.16
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RXRA-201ENST00000356384 CHP2O43745 196 aa16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
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RXRA-201ENST00000356384 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SIN3BO75182 1162 aa16.02■□□□□ 0.15
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RXRA-201ENST00000356384 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.02■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.02■□□□□ 0.15
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RXRA-201ENST00000356384 CHST4Q8NCG5 386 aa16.01■□□□□ 0.15
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RXRA-201ENST00000356384 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.01■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.01■□□□□ 0.15
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RXRA-201ENST00000356384 C12orf29Q8N999 325 aa16.01■□□□□ 0.15
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RXRA-201ENST00000356384 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.01■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PQ72 361 aa16■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.155e-6■■■■□ 20.4
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