RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SSNA1O43805 119 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 BNIP2Q12982 314 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB46Q86UZ6 589 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 AGAP11Q8TF27 550 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PGM3O95394 542 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CCNE2O96020 404 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNGP07510 517 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TACR2P21452 398 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 DMPKQ09013 629 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.32■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 GPR135Q8IZ08 494 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 APOLD1Q96LR9 279 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ABCB10Q9NRK6 738 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF222Q9UK12 451 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 DHRS12A0PJE2 317 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 H3BM21 787 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 G3V2T6 193 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 PARP15Q460N3 678 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 NEK6Q9HC98 313 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 RPTORQ8N122 1335 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0J9YYE9 177 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CCL22O00626 93 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 VIPP01282 170 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 HPS6Q86YV9 775 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 UGT2B17O75795 530 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MATN4O95460 622 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MTX3Q5HYI7 312 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 FEM1CQ96JP0 617 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 H3BNH8 94 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TCEA3O75764 348 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SLC7A2P52569 658 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 GRM3Q14832 879 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 PERM1Q5SV97 790 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN1O60635 241 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 NT5EP21589 574 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TM4SF1P30408 202 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ADRA1BP35368 520 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN9P43378 593 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ARF5P84085 180 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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PTPRM-201ENST00000332175 CDH24Q86UP0 819 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 TIMM22Q9Y584 194 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 FAM92AA1XBS5 289 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4AQ9UMR7 237 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 FAM25EA8MYX2 175 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SEC24AO95486 1093 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 SPAM1P38567 509 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-201ENST00000332175 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.29■■□□□ 1.16
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