RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CILP2Q8IUL8 1156 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND6AQ8IWF6 608 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF398Q8TD17 642 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTD2Q96FN9 168 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBK1Q9UHD2 729 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF180Q9UJW8 692 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 COQ6Q9Y2Z9 468 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPSO00116 658 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A9O60656 530 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL12P48061 93 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA9Q13797 1035 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR33Q49SQ1 333 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNPY4Q8N129 248 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAKDQ8WVC6 231 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUS1Q96E22 293 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS4Q9BTZ2 278 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM96AQ9H5X1 160 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A7Q9HAW7 530 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A10Q9HAW8 530 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT1A8Q9HAW9 530 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGK2Q9HBY8 427 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRLS1Q9UJA2 301 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSAT1Q9Y617 370 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLON5A6NGN9 336 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT38O76015 456 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCAP28676 217 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTPAP49638 278 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFATC2Q13469 925 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASA2Q15283 850 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED2Q15363 201 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90B2PQ58FF3 399 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEK5Q6P3R8 708 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMKK1Q8N5S9 505 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP2M1Q96CW1 435 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCF12Q99081 682 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCG8Q9H221 673 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC72A6NJI9 287 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF217O75362 1048 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFS3O75489 264 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM155BO75949 473 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT37O76014 449 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 OXTRP30559 389 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPRP35270 261 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCR3P51677 355 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGCGQ13326 291 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CERS6Q6ZMG9 384 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 MICALCLQ6ZW33 695 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF765Q7L2R6 523 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCAMP4Q969E2 229 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ULK4Q96C45 1275 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 EBF1Q9UH73 591 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTFP26441 200 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5DP30049 168 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD151P48509 253 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPP1Q00013 466 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREB5Q02930 508 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAM1L1Q8N609 369 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTX3LQ8TDB6 740 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQU0 124 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM221A6NGB7 291 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R296 226 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 AHSGP02765 367 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT7Q86SF2 657 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 HORMAD1Q86X24 394 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T34Q8NGX1 318 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBBP8Q99708 897 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMBIM4Q9HC24 238 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGALS13Q9UHV8 139 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP8B1Q9UNU6 501 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS56P0CW18 603 aa27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms