RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 POC1BQ8TC44 478 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CPT1BQ92523 772 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TMEM169Q96HH4 297 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 BTBD2Q9BX70 525 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.13□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 GOLGA8RI6L899 631 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RAD51BO15315 384 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CKMP06732 381 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PRPS2P11908 318 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CCDC130P13994 396 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CTRB1P17538 263 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PRDX6P30041 224 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SHMT1P34896 483 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 THOP1P52888 689 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 AQP5P55064 265 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PRKCEQ02156 737 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 BST1Q10588 318 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CCNIQ14094 377 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FAXCQ5TGI0 409 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 LPCAT4Q643R3 524 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 MACC1Q6ZN28 852 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CADM3Q8N126 398 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 GPR152Q8TDT2 470 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FAM162AQ96A26 154 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SERAC1Q96JX3 654 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FBXL18Q96ME1 805 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 BIRC8Q96P09 236 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 KCNJ15Q99712 375 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CD244Q9BZW8 370 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PARVBQ9HBI1 364 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 THAP1Q9NVV9 213 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 E5RJQ4 531 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 GAS7O60861 476 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ETS1P14921 441 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 CD58P19256 250 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TIE1P35590 1138 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 NCKAP1LP55160 1127 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 PDE1BQ01064 536 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 FOXK2Q01167 660 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TAP1Q03518 808 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 KRT81Q14533 505 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TRIP10Q15642 601 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 RGS21Q2M5E4 152 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 NADK2Q4G0N4 442 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 TEX44Q53QW1 395 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 SLFN13Q68D06 897 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ZNF410Q86VK4 478 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.12□□□□□ -0.95
MMP3-201ENST00000299855 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.12□□□□□ -0.95
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