RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LPGAT1Q92604 370 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ASF1AQ9Y294 204 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 AGPSO00116 658 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN1P07384 714 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FECHP22830 423 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 KIR3DL1P43629 444 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SULT2A1Q06520 285 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RGS1Q08116 209 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GIPC3Q8TF64 312 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SPOCK2Q92563 424 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLIT3O75094 1523 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 A8MUI8 341 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ACAP2Q15057 778 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 KLRG1Q96E93 195 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DMAC2Q9NW81 257 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQH9 124 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CDH3P22223 829 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SPPL2CQ8IUH8 684 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD9Q96Q07 612 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RNF208Q9H0X6 261 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 L1CAMP32004 1257 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 HNF4AP41235 474 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DDI2Q5TDH0 399 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CHSY3Q70JA7 882 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TSSK3Q96PN8 268 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 KIFC1Q9BW19 673 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MBD2Q9UBB5 411 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TRBC1P01850 177 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA16P05015 189 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1AP35813 382 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RPL4P36578 427 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ASMTP46597 345 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS3BPQ08380 585 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1JQ5JR12 505 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RNF44Q7L0R7 432 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1MQ96MI6 270 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TCAF1Q9Y4C2 921 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OR10H2O60403 315 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL18O94889 574 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GPIP06744 558 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CYP3A5P20815 502 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MCFD2Q8NI22 146 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LCP2Q13094 533 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LIN52Q52LA3 116 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DEF8Q6ZN54 512 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IL1BP01584 269 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RALGDSQ12967 914 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LIN54Q6MZP7 749 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IDH3BO43837 385 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TAF10Q12962 218 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CYP1B1Q16678 543 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GPR158Q5T848 1215 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TTPALQ9BTX7 342 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLC28A2O43868 658 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 STK16O75716 305 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LYNP07948 512 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 AMD1P17707 334 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PIH1D2Q8WWB5 315 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms