RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 TRIM17Q9Y577 477 aa6.05□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.05□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.05□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 EMSYQ7Z589 1322 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 A0A0B4J293 547 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 C5orf52A6NGY3 159 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 UNC119BA6NIH7 251 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 YY2O15391 372 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CYP27B1O15528 508 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DDHD2O94830 711 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 HEXBP07686 556 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ETFAP13804 333 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KLRC2P26717 231 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 YWHAQP27348 245 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PCGF2P35227 344 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SIRPAP78324 504 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PTPRCAPQ14761 206 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KRT39Q6A163 491 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TIGD4Q8IY51 512 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 GJC3Q8NFK1 279 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DNASE1L2Q92874 299 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 MIB2Q96AX9 1013 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SPSB1Q96BD6 273 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 INPP5KQ9BT40 448 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ABCG8Q9H221 673 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 HIPK3Q9H422 1215 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 NCAPD3P42695 1498 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.04□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 RFXAPO00287 272 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PPP6CO00743 305 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ST8SIA3O43173 380 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 AKAP3O75969 853 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 MT-CO3P00414 261 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CD63P08962 238 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PCNAP12004 261 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PFKFB1P16118 471 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CYP11B2P19099 503 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 NR4A1P22736 598 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CDC25CP30307 473 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CAMLGP49069 296 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TP53BP2Q13625 1128 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PDK1Q15118 436 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SHEQ5VZ18 495 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DPPA4Q7L190 304 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 WDR63Q8IWG1 891 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB2Q8N680 514 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KAT2AQ92830 837 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 MOAP1Q96BY2 351 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 NXNL1Q96CM4 212 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CHFRQ96EP1 664 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 CIPCQ9C0C6 399 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 PIGMQ9H3S5 423 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM2-201ENST00000258148 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
MDM2-201ENST00000258148 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.02□□□□□ -1.45
MDM2-201ENST00000258148 TRIM77I1YAP6 450 aa6.02□□□□□ -1.45
MDM2-201ENST00000258148 RRHO14718 337 aa6.02□□□□□ -1.45
MDM2-201ENST00000258148 REC8O95072 547 aa6.02□□□□□ -1.45
MDM2-201ENST00000258148 ALPPP05187 535 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms