RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 CAMK1Q14012 370 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LIN52Q52LA3 116 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 POU5F2Q8N7G0 328 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MBOAT7Q96N66 472 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MADDQ8WXG6 1647 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ENTPD5O75356 428 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CCNCP24863 283 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 IGFALSP35858 605 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LCP2Q13094 533 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 USP41Q3LFD5 358 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PIF1Q9H611 641 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CDH7Q9ULB5 785 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ANXA8P13928 327 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CASKO14936 926 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CCNKO75909 580 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CLDN9O95484 217 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 AP2A1O95782 977 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 HNF4AP41235 474 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 WDR18Q9BV38 432 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FAM86B1E9PN63 330 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PITPNM1O00562 1244 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CDC25CP30307 473 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 GRIA1P42261 906 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CUZD1Q86UP6 607 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FAM13CQ8NE31 585 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KLHL18O94889 574 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 METTL18O95568 372 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 GPR107Q5VW38 600 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DHRS7Q9Y394 339 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CYP2B6P20813 491 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CACNG1Q06432 222 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FAM84AQ96KN4 292 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KCNK1O00180 336 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 APOL3O95236 402 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NDST3O95803 873 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 RLN2P04090 185 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 THOP1P52888 689 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FBXO30Q8TB52 745 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MYH8P13535 1937 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 M0QX08 132 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 BMPR2Q13873 1038 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 EIPR1Q53HC9 387 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 A0A0J9YYE9 177 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 OR4C6Q8NH72 309 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 HAPLN3Q96S86 360 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ISPDA4D126 451 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 H3BUI4 141 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PSMD10O75832 226 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SNX4O95219 450 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MFSD10Q14728 455 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.99□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PDE10AQ9Y233 779 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms