RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	FLRT2	O43155	660 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CELA3B	P08861	270 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF883	P0CG24	379 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	MTHFD2	P13995	350 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CD27	P26842	260 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PSMD8	P48556	350 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC11A2	P49281	568 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	GALC	P54803	685 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PPP2CB	P62714	309 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PPP2CA	P67775	309 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	APBA1	Q02410	837 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAJC3	Q13217	504 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SHB	Q15464	509 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	TAF5	Q15542	800 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	DCAF6	Q58WW2	860 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	LGI2	Q8N0V4	545 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	STK40	Q8N2I9	435 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	JADE3	Q92613	823 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	IGSF8	Q969P0	613 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	TTC17	Q96AE7	1141 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	TSG101	Q99816	390 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CEP83	Q9Y592	693 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0G2JNJ9	132 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1B0GTL3	188 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PAX4	O43316	350 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	TNFSF14	O43557	240 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PAEP	P09466	180 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	KRT5	P13647	590 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF28	P17035	718 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	AGXT	P21549	392 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC8A1	P32418	973 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	MTNR1B	P49286	362 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CCT8	P50990	548 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	STX17	P56962	302 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CDH18	Q13634	790 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SPIDR	Q14159	915 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ACAP1	Q15027	740 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CST6	Q15828	149 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	CNGA2	Q16280	664 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	GJB7	Q6PEY0	223 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	EID2	Q8N6I1	236 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	PPM1N	Q8N819	430 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MFSD8-240	ENST00000641658	SMARCE1	Q969G3	411 aa		5.65	□□□□□ -1.5

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