RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD11	O00231	422 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MAFK	O60675	156 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PGLS	O95336	258 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SFTPC	P11686	197 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DES	P17661	470 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CTPS1	P17812	591 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	AMPD1	P23109	780 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TEAD1	P28347	426 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	HCAR3	P49019	387 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	IHH	Q14623	411 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NCAPH	Q15003	741 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH19	Q9H159	772 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DUX1	O43812	170 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD1	O60671	282 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF8	O76064	485 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PDHA1	P08559	390 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DPT	Q07507	201 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	BIRC2	Q13490	618 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQ67	120 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338		B4E171	279 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BRJ5	948 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	FZD6	O60353	706 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN7	P41732	249 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP13	P45452	471 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR1	P46091	355 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	FASLG	P48023	281 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	USP45	Q70EL2	814 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPH1	Q92598	858 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	CTRC	Q99895	268 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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