RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	CDK4	P11802	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CTSE	P14091	401 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	JUP	P14923	745 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TSHR	P16473	764 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TRIM23	P36406	574 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GEM	P55040	296 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CDK18	Q07002	472 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GSE1	Q14687	1217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GLMN	Q92990	594 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TBATA	Q96M53	351 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	LGR4	Q9BXB1	951 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CARD9	Q9H257	536 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TPP1	O14773	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	YY2	O15391	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PMPCB	O75439	489 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PRL	P01236	227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NFKB1	P19838	968 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RBL1	P28749	1068 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	HNF1B	P35680	557 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	HK3	P52790	923 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	SKOR1	P84550	965 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PPARD	Q03181	441 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	MPP3	Q13368	585 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	TCEA2	Q15560	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	HID1	Q8IV36	788 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	OPA1	O60313	960 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	RASGRP1	O95267	797 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NDST3	O95803	873 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GAS8	O95995	478 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	MT-CO3	P00414	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	MMP2	P08253	660 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ALPI	P09923	528 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	GPR1	P46091	355 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	E2F1	Q01094	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PEX6	Q13608	980 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CDKN3	Q16667	212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	P3H1	Q32P28	736 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	FCRL5	Q96RD9	977 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-208	ENST00000586312	CDH19	Q9H159	772 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms