RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169		Q6ZVL8	140 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	NPW	Q8N729	165 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-238	ENST00000568169	BLACE	A4D250	179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PRR19	A6NJB7	356 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DFFA	O00273	331 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ERCC2	P18074	760 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	LHCGR	P22888	699 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MC1R	Q01726	317 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DPT	Q07507	201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	BECN1	Q14457	450 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CA9	Q16790	459 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	STARD8	Q92502	1023 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SLC38A3	Q99624	504 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CTRC	Q99895	268 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169		A8MU76	341 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	STK17B	O94768	372 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DLGAP3	O95886	979 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SOD1	P00441	154 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	CP	P00450	1065 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TCN2	P20062	427 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NFKBIA	P25963	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MAN1A1	P33908	653 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2H	P62256	183 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KLRB1	Q12918	225 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SEPT6	Q14141	434 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	SEC16A	O15027	2179 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DAPK3	O43293	454 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	MTSS1	O43312	755 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	EML2	O95834	649 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	PEX11B	O96011	259 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	DES	P17661	470 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	STAT5A	P42229	794 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	GPR1	P46091	355 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TCF4-238	ENST00000568169	HCAR3	P49019	387 aa		11.31	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms