RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 DTD2Q96FN9 168 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 HIC2Q96JB3 615 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 APOLD1Q96LR9 279 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 COQ10AQ96MF6 247 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 AGAP3Q96P47 875 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 LYSMD1Q96S90 227 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 LGMNQ99538 433 aa5.6□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.6□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS38A1L453 326 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC1Q99614 292 aa5.59□□□□□ -1.51
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA16Q9BXB7 569 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX101Q9BY14 249 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 RBSNQ9H1K0 784 aa5.59□□□□□ -1.51
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