RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 VILLO15195 856 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 NCAM2O15394 837 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLPTM1O96005 669 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SRCP12931 536 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZXDAP98168 799 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC18A2Q05940 514 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 IL10RBQ08334 325 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 WASHC5Q12768 1159 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DMC1Q14565 340 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 C2orf27AQ580R0 203 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP33Q8TEY7 942 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 EXOC2Q96KP1 924 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERVW-1Q9UQF0 538 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC160A6NGH7 325 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 TXNDC9O14530 226 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR6B1O95007 311 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCNCP24863 283 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 LAMA1P25391 3075 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SSTR1P30872 391 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 AQP4P55087 323 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 STARD6P59095 220 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRKCQQ04759 706 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 Q6ZS52 159 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CNTD1Q8N815 330 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXO27Q8NI29 283 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DMTF1Q9Y222 760 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A088AWK7 358 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTC34A8MYJ7 566 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF103O00237 685 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 MATN3O15232 486 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNN4O15554 427 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITGAVP06756 1048 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINA6P08185 405 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 HLA-EP13747 358 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CPA3P15088 417 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 TIE1P35590 1138 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 IL12RB1P42701 662 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 RGRP47804 291 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINB8P50452 374 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DLG1Q12959 904 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 FZD5Q13467 585 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF234Q14588 700 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CYTH1Q15438 398 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGBD5Q8N414 524 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 MSANTD3Q96H12 275 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGM3O95394 542 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 JCHAINP01591 159 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHRNB1P11230 501 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 ETS1P14921 441 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 DRD1P21728 446 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRKCHP24723 683 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTPN3P26045 913 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 WASP42768 502 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAXP61244 160 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms