RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 NUDT4Q9NZJ9 180 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGSF9Q9P2J2 1179 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 A0A0U1RQF3 1178 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 MYL12BO14950 172 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SLC22A3O75751 556 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 LIMK2P53671 638 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 POMGNT2Q8NAT1 580 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 RNFT2Q96EX2 444 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CNTN3Q9P232 1028 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 POLR1DQ9Y2S0 133 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 OR10H1Q9Y4A9 318 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 STBD1O95210 358 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ASLP04424 464 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 LINC00032P0C843 101 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 RANBP1P43487 201 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CDC42P60953 191 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 DNAJB14Q8TBM8 379 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 AP2M1Q96CW1 435 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TTLL2Q9BWV7 592 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TRIM24O15164 1050 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2ABP04908 130 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SP100P23497 879 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 EPHA3P29320 983 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TTKP33981 857 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GRIA3P42263 894 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-21P61565 698 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 DPYSL2Q16555 572 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 OR7D4Q8NG98 312 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2ACQ93077 130 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 STMN3Q9NZ72 180 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 YJEFN3A6XGL0 299 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 RFXANKO14593 260 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TSPAN8P19075 237 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TSTD2Q5T7W7 516 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 PPCDCQ96CD2 204 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 MARK4Q96L34 752 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FANCEQ9HB96 536 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FNIP2Q9P278 1114 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ZNF536O15090 1300 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 PSMD8P48556 350 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TDRPQ86YL5 185 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FAM20CQ8IXL6 584 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CYP4X1Q8N118 509 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 OR52L1Q8NGH7 329 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 RERGLQ9H628 205 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 BCL10O95999 233 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ITGA1P56199 1179 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CNKSR3Q6P9H4 555 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 MACC1Q6ZN28 852 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 BRSK1Q8TDC3 778 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 OR52E6Q96RD3 313 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ZNF607Q96SK3 696 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GMLQ99445 158 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 C3orf14Q9HBI5 128 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 NRP1O14786 923 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 IRAK2O43187 625 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 STK16O75716 305 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 DGKGP49619 791 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 INAQ16352 499 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 AAGABQ6PD74 315 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FAM124AQ86V42 546 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 PROSER1Q86XN7 944 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 PYDC1Q8WXC3 89 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 KCTD13Q8WZ19 329 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 C3orf18Q9UK00 162 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 H0Y858 1186 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 LAPTM5Q13571 262 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ACAP2Q15057 778 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ZNF792Q3KQV3 632 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FNBP1LQ5T0N5 605 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TBATAQ96M53 351 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SLITRK2Q9H156 845 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SLC7A4O43246 635 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GNPDA1P46926 289 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FPGSQ05932 587 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GPAT3Q53EU6 434 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 DSELQ8IZU8 1212 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms