RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDRT15Q96T59 188 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR10A4Q9H209 315 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 EBF3Q9H4W6 596 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 OPA3Q9H6K4 179 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJC18Q9H819 358 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP25Q9NPA2 562 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FLRT1Q9NZU1 646 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERVK-11Q9UQG0 969 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 COX11Q9Y6N1 276 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 UTYO14607 1347 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1B0GVM2 712 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 LNP1A1A4G5 178 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR91A4D1P6 747 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLOD5A6NK44 160 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITM2AO43736 263 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBX10O75333 385 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFNA2P01563 188 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 AFPP02771 609 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCATP04180 440 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP3P08254 477 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXB2P14652 356 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAT1P21673 171 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CERS1P27544 350 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SSTR2P30874 369 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSH2P43246 934 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR143P51810 404 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDH13P55290 713 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPARDQ03181 441 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNC3Q14003 757 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRTGQ2VWP7 1150 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYLK3Q32MK0 819 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRBOX4Q5JUW0 171 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q5PR19 223 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MON1BQ7L1V2 547 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTF1AQ7RTS3 328 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATG9AQ7Z3C6 839 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRIMA1Q86XR5 153 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PALB2Q86YC2 1186 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 BEST3Q8N1M1 668 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEX45Q8NA69 505 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 HM13Q8TCT9 377 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEKT4Q8WW24 435 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIB2Q92519 343 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ORAI1Q96D31 301 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 COQ8BQ96D53 544 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 VCPIP1Q96JH7 1222 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SORCS2Q96PQ0 1159 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FIZ1Q96SL8 496 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDOQ99489 341 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 OLFM1Q99784 485 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNGB3Q9NQW8 809 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAS2R14Q9NYV8 317 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 INAFM1C9JVW0 142 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 M0QZ24 198 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOCS6O14544 535 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCAMP1O15126 338 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS14O43566 566 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFS7O75251 213 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 JRKO75564 520 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GGPS1O95749 300 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM11P17152 192 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAOAP21397 527 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNLYP22749 145 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms