RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP43Q70EL4 1123 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM29Q86T20 159 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM219Q86XT9 240 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL17REQ8NFR9 667 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL6Q8TCB7 284 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMARCE1Q969G3 411 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORAI1Q96D31 301 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 UHRF2Q96PU4 802 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIP5K1AQ99755 562 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSTL1Q9H114 145 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PREBQ9HCU5 417 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCF3Q9NUQ8 709 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PADI1Q9ULC6 663 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMX1BO60663 402 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBL4AP11441 157 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL7RP16871 459 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUT6P51993 359 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASP6P55212 293 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE1BQ01064 536 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLIG2Q13516 323 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALFQ53S48 1182 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF280DQ6N043 979 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFRALQ6UXV0 394 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPPA4Q7L190 304 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 KMT5CQ86Y97 462 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF34Q8IZ26 560 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR4A3Q92570 626 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDCA5Q96FF9 252 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 HARBI1Q96MB7 349 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACOX2Q99424 681 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP44Q9H0E7 712 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABI3Q9P2A4 366 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPH5 198 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM172BPA6NC97 362 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf97H3BN30 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAGE4O60829 102 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKX2-2O95096 273 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYAAP02489 173 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1A3P13637 1013 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYOD1P15172 320 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICAM3P32942 547 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FASLGP48023 281 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCR9P51686 369 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLCN3P51790 818 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R38P59533 333 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLR1P78380 273 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNG2Q16589 344 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACCSLQ4AC99 568 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRNP1Q6NT89 227 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 BEST3Q8N1M1 668 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAXEQ8NCW5 288 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM68Q96MH6 324 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 QRFPRQ96P65 431 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms