RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 BEND5Q7L4P6 421 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SNX20Q7Z614 316 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 LZTR1Q8N653 840 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SLC4A11Q8NBS3 891 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 RRN3Q9NYV6 651 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 DHRS7Q9Y394 339 aa10.56□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CPED1A4D0V7 1026 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CXCL11O14625 94 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 OR1F1O43749 312 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PAGE1O75459 146 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 C1RP00736 705 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 GZMAP12544 262 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 GNPDA1P46926 289 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CORO7P57737 925 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 DLG1Q12959 904 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MTA1Q13330 715 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 IL18R1Q13478 541 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 DLG2Q15700 870 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CERCAMQ5T4B2 595 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS6Q8IU80 811 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ZMIZ2Q8NF64 920 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 STARD8Q92502 1023 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 POLE3Q9NRF9 147 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 E9PCH4 1651 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 A0A0G2JN53 185 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 UBE2QL1A1L167 161 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 UGT2B17O75795 530 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TNFAIP8O95379 198 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 POU2F1P14859 743 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MTX3Q5HYI7 312 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 RTL4Q6ZR62 310 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CERS2Q96G23 380 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 LDAHQ9H6V9 325 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 HMG20AQ9NP66 347 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CTPS2Q9NRF8 586 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MED31Q9Y3C7 131 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CCL22O00626 93 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PGM3O95394 542 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 IFNA6P05013 189 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 RPL17P18621 184 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 NAPRTQ6XQN6 538 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TBX5Q99593 518 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 BRD7Q9NPI1 651 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MED14O60244 1454 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 FPGTO14772 594 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CASKO14936 926 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MYBL2P10244 700 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD46Q86W74 232 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ZNF615Q8N8J6 731 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TRIM64BA6NI03 449 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TRAPPC6AO75865 159 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PTNP21246 168 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 GLRA2P23416 452 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MAN2A2P49641 1150 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 VLDLRP98155 873 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 NFATC2Q13469 925 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 MAMLD1Q13495 774 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SGCBQ16585 318 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 PIGZQ86VD9 579 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 AP2M1Q96CW1 435 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TSSK3Q96PN8 268 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ZNF607Q96SK3 696 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 DIP2AQ14689 1571 aa10.55□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ZNF806P0C7X5 589 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CSH1P0DML2 217 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CSH2P0DML3 217 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 RAB10P61026 200 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 GALNT7Q86SF2 657 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 FAM35AQ86V20 835 aa10.54□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms