RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PNCKQ6P2M8 343 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 MPP5Q8N3R9 675 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 CEP76Q8TAP6 659 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 AP2M1Q96CW1 435 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PWWP2AQ96N64 755 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 IL26Q9NPH9 171 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 GPR27Q9NS67 375 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 KLF15Q9UIH9 416 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM202A6NGA9 273 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ESPNB1AK53 854 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP33O14559 1287 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 INPP4BO15327 924 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PSMD3O43242 534 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 FUCA1P04066 466 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM23P36406 574 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 CTSKP43235 329 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEA6P43360 314 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS15P98073 1019 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 IL9RQ01113 521 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 CDH17Q12864 832 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 SEPT6Q14141 434 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 FZD2Q14332 565 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TCEA2Q15560 299 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TRADDQ15628 312 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-BQ31612 363 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 C4orf22Q6V702 233 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00523Q86TU6 105 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 FAM122AQ96E09 287 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 APOOQ9BUR5 198 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TRABDQ9H4I3 376 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 UGT1A9O60656 530 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 BANF1O75531 89 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TUBB4AP04350 444 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 PRSS56P0CW18 603 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 UGT1A6P19224 532 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TPSB2P20231 275 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 UGT1A1P22309 533 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 UGT1A4P22310 534 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 MGAT1P26572 445 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 UGT1A3P35503 534 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 UGT1A5P35504 534 aa9.05□□□□□ -0.96
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PDE4D-201ENST00000309641 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 POLD2P49005 469 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ARSDP51689 593 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 C21orf59P57076 290 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 SLC7A5Q01650 507 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 DPTQ07507 201 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 SHBQ15464 509 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TEAD4Q15561 434 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 TPSAB1Q15661 275 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 IQCHQ86VS3 1027 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-201ENST00000309641 NAT14Q8WUY8 206 aa9.05□□□□□ -0.96
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