RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 ZNF398Q8TD17 642 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 VOPP1Q96AW1 172 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PTERQ96BW5 349 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 MTG2Q9H4K7 406 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 ALG9Q9H6U8 611 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 COG4Q9H9E3 785 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TMEM51Q9NW97 253 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 ANTXRLA6NF34 631 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 E9PBE3 544 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 H3BMM5 538 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 KLHL41O60662 606 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 RHOP08100 348 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 EPHA3P29320 983 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 POU4F1Q01851 419 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 ACVR1Q04771 509 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 RINLQ6ZS11 566 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PIF1Q9H611 641 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 AK5Q9Y6K8 562 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 GM2AP17900 193 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TFEBP19484 476 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 GRK2P25098 689 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 CDH13P55290 713 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 SLC7A9P82251 487 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 MESP2Q0VG99 397 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TMEM198Q66K66 360 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 ISCA2Q86U28 154 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 CALML6Q8TD86 181 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TTC1Q99614 292 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 NUF2Q9BZD4 464 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 V9GYQ6 96 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 MEI4A8MW99 385 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 TXNDC9O14530 226 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 MC4RP32245 332 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 HADHAP40939 763 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 LIPMQ5VYY2 423 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 IFNEQ86WN2 208 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 POMKQ9H5K3 350 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 IGFLR1Q9H665 355 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 ASB3Q9Y575 518 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-201ENST00000280377 DOCK9Q9BZ29 2069 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 CAPN14A8MX76 684 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 MGRN1O60291 552 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 FZD6O60353 706 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 NIPSNAP2O75323 286 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 CLDN7O95471 211 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 CA3P07451 260 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 UGT1A6P19224 532 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 UGT1A1P22309 533 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 UGT1A4P22310 534 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 UGT1A3P35503 534 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 UGT1A5P35504 534 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 STC1P52823 247 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 C1QTNF8P60827 252 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 MTA1Q13330 715 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 SGO1Q5FBB7 561 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
USP15-201ENST00000280377 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms