RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CABYRO75952 493 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 C22orf31O95567 290 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 LGALS2P05162 132 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CYP2C18P33260 490 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 BTN3A2P78410 334 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SEMA5AQ13591 1074 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 IDO1P14902 403 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GABRR2P28476 465 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 F8VP50 259 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 NR2F6P10588 404 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 33.5
LAMC1-201ENST00000258341 SP140Q13342 867 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SMPDL3BQ92485 455 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 FPGTO14772 594 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 HCN1O60741 890 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SP3Q02447 781 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 IL18R1Q13478 541 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CPTPQ5TA50 214 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GPR180Q86V85 440 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 HES2Q9Y543 173 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SLITRK3O94933 977 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 AQP1P29972 269 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 MTHFRP42898 656 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB6Q15916 424 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 S100ZQ8WXG8 99 aa16.42■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GOT1P17174 413 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PPP3R1P63098 170 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 DUSP4Q13115 394 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 NAA20P61599 178 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SPEF2Q9C093 1822 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF132P52740 706 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 C12orf29Q8N999 325 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 EHD4Q9H223 541 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CDH7Q9ULB5 785 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CLDN4O14493 209 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 APOC1P02654 83 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ASGR1P07306 291 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 AKR1D1P51857 326 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SEC13P55735 322 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SLC38A3Q99624 504 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 RNF121Q9H920 327 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 DHRS12A0PJE2 317 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 WNT10BO00744 389 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GPR107Q5VW38 600 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 MED31Q9Y3C7 131 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.41■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM64BA6NI03 449 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ADRA1DP25100 572 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PRH1P02810 166 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 IL12AP29459 219 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GALK1P51570 392 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 XKR4Q5GH76 650 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms