RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bbs2Q9CWF6 721 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ndst3Q9EQH7 873 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Golga5Q9QYE6 729 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdh23Q99PF4 3354 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm14781A2A9Q9 366 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Glyatl3E9Q5L8 290 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klc2O88448 599 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifrd1P19182 449 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TecP24604 630 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mageb5Q14AN0 366 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spa17Q62252 149 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc16a9Q7TM99 508 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef38Q80VK6 770 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 B3gnt5Q8BGY6 376 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atat1Q8K341 421 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ak1Q9R0Y5 194 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MttpO08601 894 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ChrngP04760 519 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aldh3a1P47739 453 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gdi1P50396 447 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gabrb3P63080 473 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ChatQ03059 641 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smad2Q62432 467 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr299Q7TS05 330 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kxd1Q80XH1 177 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itln1bQ80ZA0 313 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Suds3Q8BR65 328 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q8BWG4 1187 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fmo9Q8C116 539 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r214Q8R279 367 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Oma1Q9D8H7 521 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cmtm7Q9ESD6 167 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp597E9Q6S0 419 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GzmkO35205 263 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 H2-Eb1P04230 264 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 S100bP50114 92 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pfdn6Q03958 127 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mettl17Q3U2U7 461 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 InavaQ7TN12 663 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep104Q80V31 926 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc27Q80YS5 523 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc17Q8CE13 565 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Macrod1Q922B1 323 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dhrs7bQ99J47 323 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r88E9Q235 316 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm6408J3QNG1 320 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm3402K7N5P2 326 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp2b19O55071 492 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mcpt2P15119 244 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SagP20443 403 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HmgclP38060 325 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pdcd2P46718 343 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tas2r16P59529 299 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cct5P80316 541 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm11492Q5ND19 536 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp2a3Q64518 1038 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb46Q8BID6 600 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssx2ipQ8VC66 615 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc35f6Q8VE96 372 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pebp4Q9D9G2 242 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pias4Q9JM05 507 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arl10Q9QXJ4 243 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf4Q9QZS2 194 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mpp2Q9WV34 552 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clcn5Q9WVD4 746 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ajm1A2AJA9 974 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc9a3G3X939 829 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10715J3QP74 227 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01636 108 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RxraP28700 467 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wee1P47810 646 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam126aQ6P9N1 521 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sema3dQ8BH34 777 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rmdn2Q8BSE0 410 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr153Q8K0Z9 631 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cys1Q8R4T1 145 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GgcxQ9QYC7 757 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr603L7N1Y4 312 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tial1P70318 392 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc127Q3TC33 260 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Paqr6Q6TCG5 343 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc6a17Q8BJI1 727 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Txndc11Q8K2W3 948 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Papd4Q91YI6 484 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nufip1Q9QXX8 484 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnajb9Q9QYI6 222 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.7 ms