RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023343.3

Atg3-201, Transcript of Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg3, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zmynd12A2BGJ5 363 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 4931406B18RikA2RSL7 367 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zfp952B0V2W4 504 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cdr1E9Q0B4 517 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 P01807 119 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 RxraP28700 467 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Plpp4Q0VBU9 271 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Kcnc2Q14B80 642 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Adora2aQ60613 410 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Bfsp2Q6NVD9 416 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cpa1Q7TPZ8 419 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ccdc116Q80X53 541 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cfap61Q8CEL2 1252 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 StambpQ9CQ26 424 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zfp773Q9CZ29 471 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cep83Q9D5R3 692 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cldn22Q9D7U6 220 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gpr45Q9EQQ4 373 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 CtsmQ9JL96 333 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Sgk2Q9QZS5 367 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ptpn4Q9WU22 926 aa20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Myo10F8VQB6 2062 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Spin2dB1B0R2 236 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 SelenovD3YXG1 328 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rad51ap2G3UW63 976 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 MaffO54791 156 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Sstr4P49660 385 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Myo7aP97479 2215 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zfp560Q3URI6 754 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cage1Q5IR70 849 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Stmnd1Q6P3A1 279 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 SybuQ8BHS8 665 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 SowahcQ8C0J6 512 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Podxl2Q8CAE9 603 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ephb1Q8CBF3 984 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Olfr1019Q8VGS3 310 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 TcimQ9D915 106 aa20.37■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Fam43bA2AM80 330 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Olfr620E9PZ66 313 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Vmn2r96E9PZU5 664 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 GzmkO35205 263 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm5571P01639 130 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tcf3P15806 651 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ap1s1P61967 158 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 LchnQ3UHG7 455 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 RgnQ64374 299 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Clec4b1Q7TS58 209 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mppe1Q80XL7 396 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tmc7Q8C428 726 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Anxa13Q99JG3 317 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Isca2Q9DCB8 154 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cmtm7Q9ESD6 167 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rabgef1Q9JM13 491 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Umodl1Q5DID3 1319 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm11758A2BEI6 360 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm11757A2BEI8 360 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Prrg1A2BFE8 218 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm13285B1AYI3 182 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm13275B1AYI8 182 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm15155B1B034 138 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Olfr726E9Q8X3 321 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Olfr725Q05A45 321 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Adam2Q60718 735 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Casc4Q6P2L7 435 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zfp606Q7TSV0 794 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gpr62Q80UC6 358 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zcchc4Q8BKW4 512 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 IfnzQ8BQT1 182 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cndp1Q8BUG2 492 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm13278Q8CD73 182 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rnft1Q9DCN7 395 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Jam2Q9JI59 298 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gprc5dQ9JIL6 344 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cyp2g1Q9WV19 494 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Asb3Q9WV72 525 aa20.36■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Malrd1A2AJX4 2123 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm14401A2ARV7 303 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Vmn2r85G3UW56 850 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gm10715J3QP74 227 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Vmn2r46L7N282 809 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Traf2P39429 501 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 PgrQ00175 926 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Proser1Q5PRE5 913 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Lrrc8eQ66JT1 795 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Capn11Q6J756 714 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Taf1cQ6PDZ2 836 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Serpina12Q7TMF5 413 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 Camk1dQ8BW96 385 aa20.35■□□□□ 0.85
Atg3-201ENSMUST00000023343 4930513O06RikQ9D549 161 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms