RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582453.5

MSI2-215, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-215	ENST00000582453	IFNA2	P01563	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	HLA-DQA2	P01906	255 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	HSPA4	P34932	840 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	POLD2	P49005	469 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CASP6	P55212	293 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	RHAG	Q02094	409 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	GAD2	Q05329	585 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CDK18	Q07002	472 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PMPCA	Q10713	525 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SREBF2	Q12772	1141 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TCP10	Q12799	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KRT32	Q14532	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SEMA3A	Q14563	771 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KCTD2	Q14681	263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	NECTIN1	Q15223	517 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SPATA1	Q5VX52	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	LPAR1	Q92633	364 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ARRDC3	Q96B67	414 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TTC14	Q96N46	770 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SERINC2	Q96SA4	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FUZ	Q9BT04	418 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KRT23	Q9C075	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	IL25	Q9H293	177 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	EBF3	Q9H4W6	596 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	RMI1	Q9H9A7	625 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	RNF146	Q9NTX7	359 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ARL15	Q9NXU5	204 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	NYAP2	Q9P242	653 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	HSF4	Q9ULV5	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TMEM247	A6NEH6	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	MDM4	O15151	490 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SEPT4	O43236	478 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KLK10	O43240	276 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TIMM44	O43615	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	KLKB1	P03952	638 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SNHG28	P0DPA3	235 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CHRNB1	P11230	501 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CETP	P11597	493 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ACP5	P13686	325 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CHN1	P15882	459 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ABCD3	P28288	659 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PNPLA4	P41247	253 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	BACE1	P56817	501 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	LINC00205	P59089	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ZBTB16	Q05516	673 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	GALNT2	Q10471	571 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TRDN	Q13061	729 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PRKG2	Q13237	762 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PTGR1	Q14914	329 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	PLK5	Q496M5	336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	NAA35	Q5VZE5	725 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	TMEM199	Q8N511	208 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	FSIP1	Q8NA03	581 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-215	ENST00000582453	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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